Crises émergentes, la filière fruits et légumes impliquée

Au niveau européen comme national, les épisodes épidémiques liés à des aliments d’origine non animale augmentent depuis quelques années et l’actualité est régulière autour d’infections impliquant ces denrées.Quand les fruits et légumes sont à l’origine d’intoxications alimentaires ou d’épidémies, les principaux agents sont :
• des bactéries : Salmonella (par exemple, melons, mangues aux Etats-Unis en 2010 et 2011), Escherichia coli producteur de shigatoxines  (par exemple, graines germées et E.coli O104:H4, été 2011 en Allemagne, France) et, dans une moindre mesure, Listeria monocytogenes
• des virus : Norovirus (épisode des fraises « chinoises » en Allemagne, fin 2012) et virus hépatite A (épidémies en cours en Europe, petits fruits rouges surgelés)
• des parasites tels que Cyclospora (épidémie, salade mixte et coriandre Etats-Unis en 2013).
Notons au passage que si des épidémies régulières mettent en cause des pathogènes, l’autre danger relatif aux fruits et légumes est représenté par les résidus de pesticides.
Les données RASFF (réseau d’alertes européen) pour l’année 2013 confirme l’implication majoritaire des pathogènes Salmonella et virus, et en nombre moins important, Bacillus cereus et Listeria monocytogenes, avec des matrices variées : salades, épinards, maïs, tomates, melons, fruits rouges surgelés (framboises, fraises, mûres…), dattes, oignons déshydratés, champignons séchés, herbes aromatiques….
 
Modes de contamination
La flore bactérienne à la surface des fruits et